Kementerian Pertanian Korea Selatan mengatakan hari Kamis (24/7) kasus itu dikonfirmasi di sebuah peternakan babi di Uiseong, sekitar 250 kilometer sebelah tenggara ibukota, Seoul.
Kementerian itu mengatakan sekitar 600 babi dibinasakan dalam upaya membendung penyakit itu, yang juga dapat menginfeksi hewan berkuku terbelah seperti sapi dan domba.
Wabah serius penyakit kaki-dan-mulut tahun 2011 memaksa pihak berwenang di Korea Utara dan Korea Selatan memusnahkan hampir 3,5 juta ternak.
Organisasi Dunia untuk Kesehatan Hewan dengan resmi menyatakan Korea Selatan bebas PMK hanya dua bulan lalu.
Korea Utara melaporkan adanya wabah tersebut sebelumnya tahun ini sehingga mendorong Korea Selatan menawarkan vaksin dan bantuan lainnya.